Pleuraalisen mesoteliooman kasvaimen mikroympäristön tutkiminen spatiaalitranskriptomiikkaa hyväksikäyttäen

Tiivistelmä

Pleuraalinen mesoteliooma on työperäiseen asbestialtistukseen liittyvä harvinainen ja huonoennusteinen syöpä. Solutason spatiaalitranskriptomiikkaa analysoiden tutkimuksen on tavoitteena syventää ymmärrystä pleuraalisen mesoteliooman patofysiologiasta tutkimalla uuden sitoutumattoman (”uncommited”) solutyypin biomarkkereita ja edistää näin varhaisen toteamisen mahdollisuuksia. Tutkimus toteutetaan 2025–2026 Bostonissa Brigham and Women’s sairaalassa Professori Raphael Buenon tutkimusryhmässä.

Hankkeen vastuuhenkilö

Topias Karjula

Tiedote

Pleuraalisen mesoteliooman multiomiikka paljastaa uuden "sitoutumattoman" solutyypin

Tiivistelmä

Pleuraalinen mesoteliooma (PM) on harvinainen, asbestialtistukseen liittyvä syöpä, johon sairastuneiden potilaiden ennuste on edelleen huono. Kasvainsolujen monimuotoisuus vaikuttaa merkittävästi taudin kulkuun ja hoitovasteeseen. Tutkimusryhmässä on tunnistettu aiemmin kuvaamaton sitoutumaton kasvainsolutyyppi, joka liittyy huonoon ennusteeseen toimien mahdollisesti epiteliaalisen ja sarkomatoidin solutyypin esiasteena. Tässä tutkimushankkeessa kerättiin laaja aineistopohja solujen ja kudosten molekulaarisen tilan karakterisointia varten. Työn tulokset tukevat uusien diagnostisten menetelmien kehittämistä asbestialtistuneiden potilaiden seurantaan ja taudin varhaiseen toteamiseen.

Lähtökohdat

PM on aggressiivinen, asbestialtistukseen liittyvä syöpä, joka jaetaan histologisesti epiteliaaliseen ja sarkomatoidiin, ja näiden välimuotoon bifaasiseen tautimuotoon. Epiteeli-mesenkyymi transitio (EMT) on tunnistettu keskeiseksi kasvainten fenotyyppiä määrittäväksi ajuriksi. Tehokkaat hoitovaihtoehdot ovat rajalliset, ja potentiaalisia täsmälääkityksen kohteita ei olla tunnistettu. Tämän tutkimushankkeen tavoitteena oli tutkia sitoutumattoman PM solutyypin roolia kasvainten biologiassa.

Aineisto

Stipendikauden aikana hyödynnettiin Brigham and Women’s Hospitalin Kansainvälisen Mesoteliooma-ohjelman näytekokoelmaa ja sairaalan rintaelinkirurgisen osaston tutkimusinfrastruktuuria. Spitendikauden aikana rakennettiin tuorenäytteistä erityyppisiä yksisolu-RNA kirjastoja sekä spatiaalitranskriptomiikka-aineistoa arkistoiduista FFPE-leikkeistä. Lisäksi hyödynnettiin tutkimusryhmän aiempia massa-transkripti aineistoja.

Menetelmät

Tutkimus perustuu kasvainten histomolekulaarisen tilan kuvaamiseen näytetasolla massa-transkriptianalyysinä, yksittäisten solujen tasolla sekä kudostason spatiaalisen geeniekspression analyysiin. Laskennallisessa analyyseissä käytetään menetelmiä, joilla tunnistetaan solutyyppejä, verrataan geenien ilmentymistä eri potilasryhmässä sekä mallinnetaan solutilojen välisiä siirtymiä. Tulosten kliinistä merkitystä arvioidaan suhteessa potilaiden hoitovasteeseen ja ennusteeseen.

Tulokset ja johtopäätökset

Stipendikauden keskeinen saavutus on laajan, kattavasti kuratoidun aineiston rakentaminen tulevia analyysejä varten. Alustavien tulosten mukaan pleuraalisen mesoteliooman kasvaimet muuntautuvat uusiutumisen myötä kohti mesenkymaalisempaa fenotyyppiä EMT spektrillä. Syyt fenotyypin muutoksille ovat vielä tunnistamatta. Sitoutumattoman solutyypin merkitys uusiutumisten myötä on vielä epäselvä.

Uutuusarvo ja sovellettavuus

Tutkimus tuottaa uutta tietoa pleuraalisen mesoteliooman kasvainsolujen monimuotoisuudesta ja sen kliinisestä merkityksestä. Tunnistetut biomarkkerikandidaatit voivat tulevaisuudessa tukea taudin diagnostiikkaa ja ennustamista, minkä lisäksi niiden mahdollisuutta asbestialtistuneiden henkilöiden seulonnassa tutkitaan.

Aineisto

Tiivistelmä Avaa